Медико-генетический центр
лаборатория молекулярной патологии
Бесплатная горячая линия:
8 (495) 660-83-77

Сравнительная геномная гибридизация на чипах

Сравнительная геномная гибридизация на чипах

Современная технология высокого разрешения — сравнительная геномная гибридизация на чипах (aCGH) — позволяет выявлять количественные и качественные нарушения структуры хромосом. Она помогает диагностировать анеуплоидии и микроструктурные хромосомные аномалии одновременно во всех хромосомах.

Клиническое применение этого метода касается:

  • предимплантационной диагностики;
  • пренатальной диагностики;
  • диагностики в случае невынашивания беременности;
  • постнатальной диагностики (ВПР, недифференцированная умственная отсталость, моногенные патологии, в т. ч. мышечная дистрофия Дюшенна, онкологические патологии);
  • верификации данных цитогенетических исследований.

Принцип сравнительной геномной гибридизации на чипах

Метод aCGH основан на принципе сравнения двух образцов генетического материала: контрольного (полученного от заведомо здорового человека) и исследуемого. Образцы метятся при помощи зондов, их наносят на микрочип с последовательностями олигонуклеотидов, охватывая длину всех хромосом. Информацию о численности участка предоставляет соответствие интенсивности сигналов. Зеленый цвет свидетельствует о потере участка, красный говорит об увеличении численности.

Во время сравнительной геномной гибридизации на чипах проводится сканирование при помощи компьютерной программы, которая визуализирует результат в графической форме (диаграмма).

Как подготовиться к сравнительной геномной гибридизации на чипах

Процедура может проводиться двумя методами: FISH или CGH. Для каждого из них необходимы различные реактивы, разные методы подготовки проб.

FISH-метод позволяет провести исследование за 5–6 часов. Он помогает изучить ограниченное число хромосом (3, 5, 7, 9), не выявляет делеции и дупликации. Метод CGH требует для своего проведения больше времени — 36–48 ч (иногда до 72 ч, что зависит от количества анализируемых эмбрионов).

Особенности проведения сравнительной геномной гибридизации на чипах

Согласно технологии aCGH, весь исследуемый образец ДНК помечают красной флуоресцентной краской, а контрольный образец — зеленой краской. Два меченных образца смешивают в равных пропорциях и осуществляют гибридизацию с микроматрицей (чипом). Микрочип содержит до 100 000 и более однонитевых олигонуклеотидов, которые соответствуют разным уникальным последовательностям генома человека.

Уникальные последовательности для сравнительной геномной гибридизации на чипах подбирают так, чтобы они были равномерно распределены по всему геному. Соотношение красной и зеленой флюоресценции, гибридизировавшейся с олигонуклеотидными зондами в каждой позиции, позволяет говорить о преобладании конкретного сегмента ДНК, представленного этим олигонуклеотидом, в исследуемом образце по сравнению с контрольным.

Возможности и преимущества сравнительной геномной гибридизации на чипах

Метод aCGH эффективен для выявления:

геномная гибридизация на чипах
  • анеуплоидий (включая мозаицизм);
  • несбалансированных транслокаций;
  • маркерных хромосом;
  • микроделеционных/микродупликационных синдромов;
  • несбалансированных субтеломерных перестроек (del, dup, der).

Технология неэффективна при поиске инверсий, реципрокных транслокаций, робертсоновских транслокаций, точечных мутаций, реципрокных инсерций, тринуклеотидных экспансий, делеций/дупликаций (находящихся ниже границы чувствительности).

Среди достоинств сравнительной геномной гибридизации на чипах выделяют:

  • высокую разрешающую способность;
  • автоматизацию процесса (исключен человеческий фактор);
  • одномоментный скрининг всех хромосом;
  • количественную детекцию участков хромосом и однородительских дисомий;
  • объективность результатов;
  • быстроту выполнения (1–3 суток).

Среди недостатков метода можно выделить относительно высокую стоимость, большую продолжительность (по сравнению с FISH), ограничения в выявлении сбалансированных перестроек и несбалансированных перестроек за границами разрешения.

Результаты сравнительной геномной гибридизации на чипах оценивают совместно с методами классической цитогенетики.

Пройти исследование можно в медико-генетическом центре «Геномед».

Остались вопросы?
Звоните нам по телефону федеральной горячей линии8 (800) 333-45-38 или обращайтесь к нашим партнерам.
Подпишитесь на наш Instagram
Подписаться
© 2019 - Геномед - медико-генетический центр