Хромосомный микроматричный анализ плода
Молекулярное кариотипирование, которое исследует структуру всего генома плода в одном тесте и выявляет изменения, которые не обнаруживает стандартное кариотипирование.
Почему важно число и структура хромосом
Наследственная информация упакована в 23 пары хромосом: 22 пары аутосом и пару половых хромосом. Здоровье плода зависит не только от того, нет ли ошибок в отдельных генах, но и от того, сколько копий каждой хромосомы он получил и не утрачены ли её фрагменты.
Лишняя или недостающая хромосома
Избыток или нехватка целой хромосомы меняет дозу сотен генов сразу. Так, трисомия по 21-й хромосоме приводит к синдрому Дауна, по 18-й — к синдрому Эдвардса, по 13-й — к синдрому Патау.
Потеря или удвоение участка
Иногда выпадает или дублируется лишь небольшой фрагмент хромосомы. Такие микроделеции и микродупликации вызывают отдельные синдромы и не видны в обычный микроскоп при кариотипировании.
Частота выше, чем кажется
Хромосомные нарушения — одна из ведущих причин врождённых пороков развития и невынашивания беременности. Большинство случаев возникает спонтанно и не зависит от образа жизни родителей.
Насколько распространены хромосомные нарушения
Что видит микроматричный анализ и чего не видит кариотип
Стандартное кариотипирование рассматривает хромосомы в микроскоп и различает только крупные изменения. Микроматричный анализ оценивает геном по более чем миллиону точек и распознаёт нарушения в десятки раз мельче.
Различает только крупные перестройки — целые хромосомы и изменения примерно от 5–10 млн пар оснований. Требует деления клеток в культуре.
порог ≈ 5–10 MbОбнаруживает анеуплоидии и микроделеции/микродупликации от 100 000 пар оснований, а в клинически значимых участках — ещё мельче.
порог от 0,1 Mb · в 100 раз вышеЧто выявляет пренатальный микроматричный анализ
В одном исследовании оценивается весь геном плода — от целых хромосом до отдельных участков.
Полногеномная оценка дисбаланса числа копий и участков потери гетерозиготности на матрице высокой плотности (1,16 млн маркеров).
Анеуплоидии
Лишние или недостающие целые хромосомы, включая синдромы Дауна, Эдвардса, Патау и аномалии половых хромосом.
Триплоидии
Полный дополнительный набор хромосом — частая причина ранней потери беременности.
Делеции и дупликации
Утраченные или удвоенные участки хромосом, лежащие в основе микроделеционных и микродупликационных синдромов.
Однородительская дисомия
Обе копии хромосомы получены от одного родителя — важно при болезнях геномного импринтинга.
Спинальная мышечная атрофия
Гомозиготная делеция 7-го экзона гена SMN1 — наиболее частая молекулярная причина СМА.
Дистрофия Дюшенна/Беккера
Делеции и дупликации в гене DMD, вызывающие наследственную мышечную дистрофию.
Когда назначают исследование
Анализ проводится по направлению врача на материале, полученном при инвазивной процедуре, в следующих клинических ситуациях.
Маркеры на УЗИ. Увеличение толщины воротникового пространства, гипоплазия носовой кости и другие ультразвуковые признаки.
Пороки развития плода. Аномалии внутренних органов, головного мозга или скелета, выявленные при ультразвуковом исследовании.
Высокий риск по НИПТ. Повышенный риск трисомии или микроделеционного синдрома по результатам неинвазивного теста.
Хромосомная патология в семье. Ребёнок с установленным хромосомным нарушением у пары.
Носительство перестройки у родителя. Сбалансированная транслокация у одного из будущих родителей.
Отягощённый анамнез. Случаи невынашивания и врождённых пороков развития в семье.
При установлении высокого риска по неинвазивному пренатальному тесту лаборатории «Геномед» микроматричный анализ (код 0589) выполняется в рамках действующего предложения — уточняйте условия у клиентского сервиса.
Как устроено исследование
| Технология | Олигонуклеотидная микроматрица высокой плотности |
| Маркеров на матрице | 1,16 млн, покрывают все клинически значимые участки генома |
| Разрешение | от 100 000 п. н., в отдельных регионах — от 10 000 п. н. |
| Биоматериал | ворсины хориона, амниотическая жидкость, пуповинная кровь |
| Культивирование клеток | не требуется — исключает риск неудачного культивирования клеток и связанных с этим задержек |
| Результат | заключение врача-генетика |
ДНК плода сравнивается с эталонным геномом более чем по миллиону маркеров. Участки, где материала больше или меньше нормы, отмечаются как вариации числа копий (CNV).
Хромосомный микроматричный анализ пренатальный
Молекулярное кариотипирование плода: полногеномная оценка числа копий ДНК и участков потери гетерозиготности. Высокая точность при выявлении перестроек, не видимых в обычный микроскоп.
Путь исследования
Консультация
Врач-генетик определяет показания и подбирает вид пренатальной диагностики.
Забор материала
Биоматериал получают при инвазивной процедуре — биопсии хориона или амниоцентезе.
Анализ
ДНК плода исследуется на микроматрице высокой плотности без культивирования клеток.
Заключение
Врач-генетик готовит заключение и разъясняет результат в течение 7 рабочих дней.
Что важно знать
Чем анализ отличается от НИПТ?
Неинвазивный пренатальный тест — скрининг по крови матери, оценивающий риск частых трисомий. Микроматричный анализ — точная диагностика на материале плода, охватывающая весь геном, включая микроделеционные синдромы.
Нужна ли инвазивная процедура?
Да. Для исследования используют ворсины хориона, амниотическую жидкость или пуповинную кровь. Процедуру выполняет врач по показаниям.
Почему результат готов быстрее кариотипа?
Метод не требует выращивания клеток в культуре. Это исключает неудачи культивирования и сокращает срок до 7 рабочих дней.
О чём говорит результат?
Заключение показывает, есть ли у плода клинически значимые изменения числа или структуры хромосом. Его интерпретирует и разъясняет врач-генетик.
Аналитические возможности
Полногеномная оценка CNV и участков потери гетерозиготности; детекция анеуплоидий, триплоидий, несбалансированных перестроек, однородительской дисомии, делеции 7-го экзона SMN1 и перестроек гена DMD.
Разрешение и покрытие
Матрица 1,16 млн маркеров; разрешение от 100 000 п. н., в отдельных регионах от 10 000 п. н. По данным литературы — дополнительно 6–7 % патогенных находок у плодов с нормальным кариотипом и ВПР.
Ограничения метода
Микроматричный анализ не выявляет сбалансированные перестройки и точечные мутации вне целевых локусов, а также низкоуровневый мозаицизм ниже порога чувствительности матрицы.
Преаналитика
Не требует культивирования клеток, что устраняет риск неудач культуры и контаминации материнскими клетками при корректном заборе. Биоматериал — ворсины хориона, АЖ, пуповинная кровь.
Остались вопросы об исследовании?
Клиентский сервис лаборатории «Геномед» работает круглосуточно. Врач-генетик поможет определить показания и подобрать оптимальный вид пренатальной диагностики.